Уровенный режим Иркутского водохранилища отличается сезонными колебаниями: в апреле — мае ежегодно отмечаются самый низкий уровень воды, в сентябре-октябре — самый высокий.
Причиной понижения уровня воды Иркутского водохранилища в первой половине мая стало увеличение сбросных расходов Иркутской ГЭС, а также климатические особенности весны 2021 г., при которых наблюдалась контрастная погода, с частыми возвратами холода, растянутым снеготаянием с потерями снега на испарение и, в следствие этого, замедленное повышение притока воды в водохранилище.
По состоянию на 2 июня 2021 года на акватории Иркутского водохранилища гидрологическая обстановка значительно улучшилась — отмечается устойчивое повышение уровня воды. По данным наблюдений гидрологического поста Патроны — Иркутское водохранилище с 19 мая уровень воды повысился на 55 см.